学院奖学金资源丰富，每学年在校本科生奖学金覆盖比例高达40%以上，包括国家奖学金、上海市奖学金、复旦大学优秀学生奖学金和校外冠名奖学金等，激励学院本科学生刻苦学习、奋发向上，促进其德、智、体全面发展。
学院鼓励学生早期参与科研活动和进入专业实验室，制订了《公共卫生学院本科生科学研究项目的管理办法》，通过让学生选择参加教师科研项目或学生自己设立公共卫生预防医学研究项目，建立课题征集、项目评审、执行与考核、项目档案管理等教学管理程序与方法，实现本科生早期参与科研活动，提高团队教学综合水平。目前项目已开展四年，3名学生已有相关科研论文发表。今后学院将每年至少资助5个本科生参与科研项目，力争能在教学成果评定中取得一定成果。